1993年-2000年，省局完成航空运输总周转量20.41亿吨公里，旅客运输量2065.28万人次，货邮运输量36.2万吨，旅客吞吐量4308.33万人，货邮吞吐量65.1万吨。各项生产指标年均增长速度均大大高于全国民航年均增长速度，航空运输生产量在全国民航所占的比重逐年增加，所处的名次逐年靠前，跃入全国民航前七位的先进先行列。1999年，昆明机场旅客吞吐量达到了757.9万人次，在全国机场中名列第四。
    经济效益显著：省局加强投入产出管理，产业水平和经济效益有较大提高。1992年7月至1997年7月，省局（公司）飞机平均日利用率B737为8.10小时、B767为8.65小时，客座利用率B737为80.57%、B767为58.35%，完成主营业务收入61.65亿元，主营业务支出43.54亿元，其它业务收入1.16亿元，主营业务税金1.89亿元，上交民航基金5.09亿元，实现利润4.42亿元，完成固定资产总投资9.43亿元，先后建成了气象、飞行、安检、雷达、航修厂、运输业务楼和培训中心、机库、航材库等生产设施。1998年－2000年，省局（公司）完成运输总周转量11.23亿吨公里，主营业务收85.9亿元，主营业务成本57.6亿元，实现净利润6.97亿元。“九五”期间，省局（公司）连续五年保持盈利，上交民航基金8.1亿元，上交主营业务税金及附加税4.09亿元，上交所得税3.24亿元，完成固定资产投资26亿元，1998、1999年盈利水平居全民航之首。